Quellenregister / Source register

Zweck. Das Register hält je Quelle fest: Domäne, Zugriffsweg, Lizenz, Qualitätsstufe und Prüfstand. Der Prüfstand ist die Neuerung in v0.3 und setzt Einschränkung L10 des Papers um.

Purpose. For each source the register records domain, access route, licence, quality tier and verification status. Verification status is new in v0.3 and implements limitation L10 of the paper.

Qualitätsstufen / Quality tiers

Stufe Bedeutung DE Meaning EN
A begutachtet oder formaler Standard peer-reviewed or formal standard
B kuratiert, etabliert, institutionell getragen curated, established, institutionally maintained
C Community oder Aggregator, keine durchgängige Kuratierung community or aggregator, no consistent curation
D veraltet, eingeschränkt oder nur mit Vorbehalt nutzbar deprecated, restricted or usable only with caveats

Prüfstand / Verification status

Kennung Bedeutung DE Meaning EN
G in dieser Runde direkt gegen den Verlags- oder Betreibernachweis geprüft (2026-09-04) verified directly against publisher or operator record in this round
Ü aus v0.1 übernommen, in dieser Runde nicht nachgeprüft carried over from v0.1, not re-verified in this round
A Aussage über den Änderungsstand geprüft, Volltext nicht amendment status checked, full text not read

Regel. Nur mit G gekennzeichnete Einträge dürfen im Paper als geprüft zitiert werden. Einträge mit Ü sind vor Schwelle B (Zeitschrifteneinreichung) entweder zu prüfen oder zu entfernen.


1. Evidenzmethodik / Evidence methodology

# Quelle Nutzung im System Stufe Prüfstand
1 GRADE Working Group, Guyatt et al. 2008, BMJ 336:924, doi:10.1136/bmj.39489.470347.AD Herkunft der Klassenordnung; ausdrücklich nicht als Konformität beansprucht A G
2 GRADE Handbook (gradepro.org/handbook) Beleg für die Aussage, dass GRADE kein quantitatives System ist (§4.1) A G
3 Cochrane Handbook v6 Bias-Domänen für Modifikatoren A Ü
4 RoB 2, Sterne et al. 2019, BMJ 366:l4898 Modifikator „Bias-Risiko hoch/unklar” A Ü
5 ROBINS-I Bias bei nicht randomisierten Studien A Ü
6 PRISMA 2020 Kennzeichnung systematischer Übersichten A Ü
7 Schlesinger et al. 2019, Eur J Epidemiol, doi:10.1007/s10654-019-00531-4 Beleg gegen willkürliche Zahlenschwellen; Begründung für §5 A G

2. Literatur und Studienregister / Literature and trial registries

# Quelle Nutzung Stufe Prüfstand
8 PubMed / MEDLINE (NCBI E-utilities) Publikationsmetadaten, PMID, Rückzugskennzeichen A Ü
9 Europe PMC Zweitweg, Volltext-Metadaten A Ü
10 ClinicalTrials.gov API v2 (clinicaltrials.gov/api/v2/) Studienstatus, NCT-ID, Design A G — klassische API am 25.06.2024 abgeschaltet, Connector auf v2 umzustellen
11 EU CTIS / EudraCT europäische Studien A Ü
12 Rückzugsdaten über die Crossref-REST-API (Feld update-to), Bestand seit 09/2023 bei Crossref Modifikator „zurückgezogen” (Faktor 0,00) B G — Bezugsweg geändert, Weboberfläche von Retraction Watch nicht mehr für Massenabfragen geeignet
13 Crossref REST DOI-Auflösung, Metadaten, Rückzüge (siehe 12) B G
14 bioRxiv / medRxiv Preprint-Erkennung (Faktor 0,50) C Ü

3. Chemie / Chemistry

# Quelle Nutzung Stufe Prüfstand
15 ChEMBL, Zdrazil et al. 2024, NAR 52(D1):D1180, doi:10.1093/nar/gkad1004 Bioaktivität, Assay-Metadaten A G
16 ChEMBL Rückblick, J Cheminform 2025, doi:10.1186/s13321-025-00963-z Schema- und Umfangsstand (78 Tabellen ab Release 35) A G
17 PubChem Substanzabgleich, Synonyme B Ü
18 RDKit InChI/SMILES-Prüfung, Normalisierung B Ü
19 InChI, Heller et al. 2015, doi:10.1186/s13321-015-0068-4 Identitätsschlüssel A G
20 SMILES, Weininger 1988, doi:10.1021/ci00057a005 Strukturnotation A G
21 LOTUS, Rutz et al. 2022, eLife 11:e70780, doi:10.7554/eLife.70780 Substanz-Organismus-Verknüpfung A G
22 COCONUT (Naturstoffsammlung) Abgleich Naturstoffraum C Ü
23 ChemSpider Synonymabgleich, eingeschränkte Lizenz C Ü

4. Proteine und Gene / Proteins and genes

# Quelle Nutzung Stufe Prüfstand
24 UniProt, NAR 2023, doi:10.1093/nar/gkac1052 Zielproteine, Kennungen A Ü
25 NCBI Gene Genzuordnung A Ü
26 HGNC Gennamen-Kanonisierung A Ü
27 NCBI Taxonomy Organismus-Kanonisierung (L4) A Ü
28 PDB Strukturbezug, nur Verweis A Ü
29 AlphaFold DB Strukturvorhersage, ausschließlich In-silico-Rang 7 B Ü

5. Signalwege und Systembiologie / Pathways and systems biology

# Quelle Nutzung Stufe Prüfstand
30 Reactome, Milacic et al. 2024, NAR 52(D1):D672, doi:10.1093/nar/gkad1025 Signalwegwissen A G
31 KEGG nicht nutzen bis geklärt — akademische Freinutzung setzt Zugehörigkeit zu einer akademischen oder öffentlichen Einrichtung voraus, die hier nicht vorliegt; Vorschlag: streichen, Reactome deckt den Bedarf D G
32 WikiPathways Community-Signalwege C Ü
33 Gene Ontology Funktionsannotation A Ü
34 STRING Interaktionen, nur als Hypothesengeber B Ü
35 Open Targets, Buniello et al. 2025, NAR 53(D1):D1467, doi:10.1093/nar/gkae1128 Ziel-Krankheits-Assoziationen mit eigenem Bewertungsmodell A G

6. Pharmakovigilanz / Pharmacovigilance

# Quelle Nutzung Stufe Prüfstand
36 FDA FAERS Nebenwirkungsmeldungen; Meldeverzerrung als Modifikator, nie als Wirknachweis B Ü
37 EMA EudraVigilance (öffentlicher Teil) europäischer Gegenpart B Ü
38 WHO VigiAccess Zusatzsignal, ohne Nennerdaten C Ü
39 BfArM / AGES Rote-Hand-Briefe nationale Sicherheitsmitteilungen B Ü

7. Standards und Codierung / Standards and coding

# Quelle Nutzung Stufe Prüfstand
40 LOINC, McDonald et al. 2003, doi:10.1373/49.4.624 Codierung der Biomarkerwerte (M4, verpflichtend) A G — frei unter der Lizenz auf loinc.org, Namensnennung erforderlich
41 SNOMED CT Befundtexte; Österreich ist Mitglied, Nutzung im Inland kostenfrei, setzt aber eine Affiliate-Lizenz über das nationale Release-Center voraus B G
42 HL7 FHIR R4/R5 Austauschformat für Laborbefunde A Ü
43 UCUM Einheiten A Ü
44 W3C PROV-DM Provenienzmodell auf jeder Kante A Ü
45 FAIR-Prinzipien, Wilkinson et al. 2016, doi:10.1038/sdata.2016.18 Datenhaltung A Ü

8. Recht und Regulierung / Law and regulation

# Quelle Nutzung Stufe Prüfstand
46 Verordnung (EU) 2016/679 DSGVO Art. 9 Rechtsgrundlage, Art. 15/17/20, Art. 35 A Ü
47 Verordnung (EU) 2017/745 MDR Qualifikationsprüfung §7.1 A Ü
48 Verordnung (EU) 2017/746 IVDR Qualifikationsprüfung §7.1 A Ü
49 MDCG 2019-11 Rev. 1 (Juni 2025) modulweise Bewertung, Grenzmodul M5 A G
50 Verordnung (EU) 2024/1689 KI-VO, Änderungsstand 2026 Art. 3 Abs. 1, Art. 2 Abs. 6, Art. 50, Fristen A A
51 Verordnung (EU) 2025/327 EHDS Zeitplan Sekundärnutzung, Zugangsstellen A A
52 DSG (Österreich) nationale Ergänzung A Ü
53 ECG § 5 (Österreich) Offenlegung der öffentlichen Netzseite A Ü

9. Patente / Patents

# Quelle Nutzung Stufe Prüfstand
54 EPO OPS / Espacenet Patentlage zu Substanzen, rein informativ B Ü
55 SureChEMBL chemisch annotierte Patentdokumente B Ü

Runde 2 (2026-09-04)

Sechs weitere Quellen geprüft, vier Befunde mit Änderungsbedarf. Einzelheiten in intern/FORSCH-PROV0427_biologic-fbs-paper_quellenpruefung-runde2_v0.3_2026-09-04_DE.md.

Zusammenfassung Prüfstand / Verification summary

Kennung Anzahl Anteil
G geprüft 2026-09-04 (zwei Runden) 18 32,7 %
A Änderungsstand geprüft 2 3,6 %
Ü übernommen, ungeprüft 35 63,6 %
Summe 55 100 %

Folge für die Werkstufe. Mit 32,7 % geprüften Quellen ist das Werk nicht einreichungsreif für Schwelle B. Für den Zenodo-Preprint (Schwelle A) genügt der Stand, sofern das Paper die Quote nennt — was §9 (L10) und Anhang B tun. Vor Zeitschrifteneinreichung ist der Ü-Bestand entweder zu prüfen oder aus dem Register zu entfernen.

Consequence. At 32.7 % verified, the work is not ready for threshold B (journal submission). For the Zenodo preprint (threshold A) the status is sufficient provided the paper states the rate, which §9 (L10) and Appendix B do. Before journal submission, the Ü entries must be verified or removed.


Lizenzhinweise mit Handlungsbedarf / Licence notes requiring action

Quelle Punkt Handlung
KEGG (31) akademische Freinutzung verlangt institutionelle Zugehörigkeit — liegt nicht vor streichen oder lizenzieren; Reactome (30) deckt den Bedarf ab
SNOMED CT (41) Republikslizenz Österreich vorhanden, Affiliate-Lizenz dennoch zu beantragen Antrag über das nationale Release-Center stellen, bevor SNOMED-Inhalte importiert werden
ChemSpider (23) Nutzungsbedingungen begrenzen Weiterverbreitung nur Verweis speichern, keine Massenübernahme
FAERS (36) keine Nennerdaten, starke Meldeverzerrung ausschließlich als Modifikator, nie als Wirknachweis — im Code durchgesetzt

Fußzeile: Thomas Schüller · Syntagma Forschung, Wien · forschung@tschueller.com · ORCID 0009-0003-9799-6747 · CC BY 4.0 · Quellenregister v0.3 · 2026-09-04